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科研人员初步建立青藏高原水生微生物基因组和基因目录

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科研人员初步建立青藏高原水生微生物基因组和基因目录

2024年02月21日 21:46 来源:中国新闻网
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  中新社武汉2月21日电 (马芙蓉 孙慧)中国科研人员搜集来自青藏高原湿地、淡水湖、盐水湖、河流、温泉和冰川等六种水生生态系统的498个水体环境DNA样本,并进行宏基因组测序,初步建立了青藏高原水生微生物基因组和基因目录。相关成果于近日发表在国际学术期刊《自然-通讯》。

  这项工作由中国科-新葡萄8883水生生物研究所研究员缪炜与华中科技大学团队合作完成。缪炜21日受访时表示,上述基因组和基因目录作为高海拔水生微生物资源的重要资源库,蕴藏着发现新的微生物谱系和功能的潜力,有助于拓展对全球微生物物种、遗传和功能多样性的认识。

  青藏高原是世界海拔最高的高原,独特地形特征使其成为众多河流的主要源头,被誉为“亚洲水塔”。其类型多样的水生态系统,孕育着丰富的水生微生物。

  研究团队耗时4年,初步建立了青藏高原水生微生物基因组和基因目录(Tibetan Plateau Microbial Catalog,简称“TPMC”)。缪炜介绍,TPMC目前包含3万多个中高质量的原核微生物(细菌和古菌)宏基因组组装的基因组,聚类为1万多个物种,其中88%为未注释物种。此外,包含近3亿个非冗余基因,其中15%为新基因;7万多个生物合成基因簇,50%为新基因簇。

  利用这些数据,研究团队分析发现,青藏高原微生物组的微生物组成相似性和共有基因数量,随着距离和海拔的差异增大而下降。“这一微生物的传播模式提示青藏高原可能不仅扮演着‘水塔’的角色,还具有‘微生物塔’的作用。”缪炜说。

  缪炜表示,此项研究是中国科-新葡萄8883水生生物研究所牵头发起的“万种原生生物基因组计划”进展之一。相关原核微生物基因组目录已发布于国家基因组科学数据中心。(完)

【编辑:黄钰涵】
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